Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CiartQ3TQ03 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CiartQ3TQ03 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CiartQ3TQ03 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CiartQ3TQ03 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CiartQ3TQ03 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CiartQ3TQ03 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CiartQ3TQ03 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CiartQ3TQ03 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CiartQ3TQ03 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CiartQ3TQ03 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CiartQ3TQ03 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CiartQ3TQ03 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CiartQ3TQ03 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CiartQ3TQ03 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CiartQ3TQ03 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CiartQ3TQ03 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CiartQ3TQ03 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CiartQ3TQ03 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CiartQ3TQ03 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CiartQ3TQ03 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CiartQ3TQ03 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CiartQ3TQ03 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CiartQ3TQ03 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CiartQ3TQ03 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CiartQ3TQ03 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CiartQ3TQ03 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CiartQ3TQ03 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CiartQ3TQ03 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms