Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms