Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CA9Q16790 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CA9Q16790 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CA9Q16790 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CA9Q16790 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CA9Q16790 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CA9Q16790 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CA9Q16790 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CA9Q16790 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CA9Q16790 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CA9Q16790 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CA9Q16790 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA9Q16790 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CA9Q16790 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA9Q16790 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA9Q16790 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA9Q16790 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA9Q16790 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA9Q16790 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CA9Q16790 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA9Q16790 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA9Q16790 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA9Q16790 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA9Q16790 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA9Q16790 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA9Q16790 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA9Q16790 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA9Q16790 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA9Q16790 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA9Q16790 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA9Q16790 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA9Q16790 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA9Q16790 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA9Q16790 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA9Q16790 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA9Q16790 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA9Q16790 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA9Q16790 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA9Q16790 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA9Q16790 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA9Q16790 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CA9Q16790 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA9Q16790 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA9Q16790 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CA9Q16790 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CA9Q16790 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA9Q16790 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA9Q16790 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA9Q16790 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA9Q16790 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA9Q16790 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA9Q16790 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA9Q16790 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA9Q16790 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA9Q16790 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA9Q16790 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA9Q16790 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA9Q16790 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA9Q16790 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA9Q16790 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CA9Q16790 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA9Q16790 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA9Q16790 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CA9Q16790 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA9Q16790 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA9Q16790 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA9Q16790 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA9Q16790 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA9Q16790 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA9Q16790 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA9Q16790 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA9Q16790 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA9Q16790 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CA9Q16790 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA9Q16790 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA9Q16790 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA9Q16790 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CA9Q16790 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CA9Q16790 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA9Q16790 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA9Q16790 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA9Q16790 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA9Q16790 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA9Q16790 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA9Q16790 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA9Q16790 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA9Q16790 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA9Q16790 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA9Q16790 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA9Q16790 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA9Q16790 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA9Q16790 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA9Q16790 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA9Q16790 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA9Q16790 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CA9Q16790 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CA9Q16790 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CA9Q16790 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CA9Q16790 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CA9Q16790 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
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