Protein–RNA interactions for Protein: Q15041

ARL6IP1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL6IP1Q15041 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL6IP1Q15041 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL6IP1Q15041 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL6IP1Q15041 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL6IP1Q15041 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARL6IP1Q15041 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARL6IP1Q15041 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARL6IP1Q15041 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARL6IP1Q15041 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARL6IP1Q15041 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARL6IP1Q15041 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARL6IP1Q15041 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL6IP1Q15041 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms