Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNX3Q13761 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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