Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIGQ13278 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RIGQ13278 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIGQ13278 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIGQ13278 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIGQ13278 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIGQ13278 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIGQ13278 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIGQ13278 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIGQ13278 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIGQ13278 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIGQ13278 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RIGQ13278 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIGQ13278 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIGQ13278 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIGQ13278 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIGQ13278 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIGQ13278 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIGQ13278 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIGQ13278 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIGQ13278 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIGQ13278 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIGQ13278 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIGQ13278 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIGQ13278 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIGQ13278 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIGQ13278 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIGQ13278 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIGQ13278 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIGQ13278 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIGQ13278 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIGQ13278 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIGQ13278 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIGQ13278 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIGQ13278 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIGQ13278 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIGQ13278 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIGQ13278 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIGQ13278 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIGQ13278 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIGQ13278 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIGQ13278 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIGQ13278 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIGQ13278 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIGQ13278 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIGQ13278 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIGQ13278 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIGQ13278 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIGQ13278 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIGQ13278 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIGQ13278 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIGQ13278 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIGQ13278 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIGQ13278 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIGQ13278 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIGQ13278 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIGQ13278 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIGQ13278 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIGQ13278 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIGQ13278 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIGQ13278 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIGQ13278 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIGQ13278 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIGQ13278 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIGQ13278 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIGQ13278 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIGQ13278 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIGQ13278 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIGQ13278 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIGQ13278 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIGQ13278 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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