Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM28Q13263 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
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