Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf9Q07105 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms