Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Siah2Q06986 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.8 ms