Protein–RNA interactions for Protein: Q06616

YPR174C, Nuclear envelope protein YPR174C, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPR174CQ06616 INP52YNL106C 3552 nt2.55□□□□□ -2
YPR174CQ06616 GYP7YDL234C 2241 nt2.54□□□□□ -2
YPR174CQ06616 VPS27YNR006W 1869 nt2.54□□□□□ -2
YPR174CQ06616 RAD5YLR032W 3510 nt2.54□□□□□ -2
YPR174CQ06616 PGS1YCL004W 1566 nt2.54□□□□□ -2
YPR174CQ06616 NEM1YHR004C 1341 nt2.54□□□□□ -2
YPR174CQ06616 ABD1YBR236C 1311 nt2.54□□□□□ -2
YPR174CQ06616 RAD55YDR076W 1221 nt2.54□□□□□ -2
YPR174CQ06616 BUR6YER159C 429 nt2.54□□□□□ -2
YPR174CQ06616 YER165C-AYER165C-A 357 nt2.54□□□□□ -2
YPR174CQ06616 YIL086CYIL086C 309 nt2.54□□□□□ -2
YPR174CQ06616 FMC1YIL098C 468 nt2.54□□□□□ -2
YPR174CQ06616 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.54□□□□□ -2
YPR174CQ06616 LTO1YNL260C 597 nt2.54□□□□□ -2
YPR174CQ06616 TFC1YBR123C 1950 nt2.54□□□□□ -2
YPR174CQ06616 TIF4631YGR162W 2859 nt2.54□□□□□ -2
YPR174CQ06616 VPS64YDR200C 1815 nt2.54□□□□□ -2
YPR174CQ06616 URC2YDR520C 2319 nt2.53□□□□□ -2
YPR174CQ06616 BCS1YDR375C 1371 nt2.53□□□□□ -2
YPR174CQ06616 MGA1YGR249W 1371 nt2.53□□□□□ -2
YPR174CQ06616 RRT13YER066W 558 nt2.53□□□□□ -2
YPR174CQ06616 DOG1YHR044C 741 nt2.53□□□□□ -2
YPR174CQ06616 YKR033CYKR033C 426 nt2.53□□□□□ -2
YPR174CQ06616 SSO2YMR183C 888 nt2.53□□□□□ -2
YPR174CQ06616 CNS1YBR155W 1158 nt2.53□□□□□ -2
YPR174CQ06616 LCB4YOR171C 1875 nt2.53□□□□□ -2
YPR174CQ06616 MOT1YPL082C 5604 nt2.53□□□□□ -2
YPR174CQ06616 TEC1YBR083W 1461 nt2.52□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 TOP1YOL006C 2310 nt2.52□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 PRP8YHR165C 7242 nt2.52□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 DBP7YKR024C 2229 nt2.52□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 UTP25YIL091C 2166 nt2.52□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 TSC11YER093C 4293 nt2.52□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 NHP10YDL002C 612 nt2.52□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 SPC3YLR066W 555 nt2.52□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 CDA2YLR308W 939 nt2.52□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 RPL13BYMR142C 600 nt2.52□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 MCA1YOR197W 1299 nt2.52□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 YAT2YER024W 2772 nt2.52□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 CEP3YMR168C 1827 nt2.52□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 TCB2YNL087W 3537 nt2.51□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 EMP70YLR083C 2004 nt2.51□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 YHR078WYHR078W 1659 nt2.51□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 UBP14YBR058C 2346 nt2.51□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.51□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 YKL177WYKL177W 339 nt2.51□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 PPA2YMR267W 933 nt2.51□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 RSE1YML049C 4086 nt2.51□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 TRA1YHR099W 11235 nt2.5□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 ALG1YBR110W 1350 nt2.5□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 EPO1YMR124W 2832 nt2.5□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 SDT1YGL224C 843 nt2.5□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 ERV29YGR284C 933 nt2.5□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 RPS21BYJL136C 264 nt2.5□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 JIP3YLR331C 378 nt2.5□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 YPL276WYPL276W 438 nt2.5□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 ATG13YPR185W 2217 nt2.5□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 YGR117CYGR117C 1431 nt2.5□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 HER2YMR293C 1395 nt2.49□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 NMA111YNL123W 2994 nt2.49□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 MEF1YLR069C 2286 nt2.49□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 YPL150WYPL150W 2706 nt2.49□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 SRO9YCL037C 1305 nt2.49□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 SIN3YOL004W 4611 nt2.49□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 YDL162CYDL162C 357 nt2.49□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 YDR249CYDR249C 1122 nt2.49□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 PNC1YGL037C 651 nt2.49□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 ATP12YJL180C 978 nt2.49□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 ERP1YAR002C-A 660 nt2.49□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 SSU72YNL222W 621 nt2.49□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 HBT1YDL223C 3141 nt2.49□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 APM1YPL259C 1428 nt2.49□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 ISM1YPL040C 3009 nt2.49□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 SLP1YOR154W 1764 nt2.49□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 PFF1YBR074W 2931 nt2.48□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 CUS1YMR240C 1311 nt2.48□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 CBP2YHL038C 1893 nt2.48□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 NFT1YKR103W 3657 nt2.48□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 RIM1YCR028C-A 408 nt2.48□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 RPC11YDR045C 333 nt2.48□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 YJL028WYJL028W 336 nt2.48□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 TFC4YGR047C 3078 nt2.48□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 ESL1YIL151C 3357 nt2.48□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 RAD7YJR052W 1698 nt2.47□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 YGR067CYGR067C 2415 nt2.47□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 RRP1YDR087C 837 nt2.47□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.47□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.47□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.47□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.47□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.47□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.47□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 MPD1YOR288C 957 nt2.47□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 MCM16YPR046W 546 nt2.47□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 XRN1YGL173C 4587 nt2.47□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 GAT2YMR136W 1683 nt2.47□□□□□ -2.01
YPR174CQ06616 DNA2YHR164C 4569 nt2.46□□□□□ -2.02
YPR174CQ06616 YBR238CYBR238C 2196 nt2.46□□□□□ -2.02
YPR174CQ06616 CHS3YBR023C 3498 nt2.46□□□□□ -2.02
YPR174CQ06616 DSN1YIR010W 1731 nt2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 163.3 ms