Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Epha4Q03137 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms