Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE1BQ01064 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms