Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cmklr1P97468 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmklr1P97468 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms