Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2IP78347 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms