Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP1P59025 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP1P59025 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP1P59025 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP1P59025 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP1P59025 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP1P59025 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP1P59025 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP1P59025 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP1P59025 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP1P59025 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP1P59025 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP1P59025 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP1P59025 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP1P59025 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP1P59025 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP1P59025 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP1P59025 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP1P59025 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP1P59025 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP1P59025 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP1P59025 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP1P59025 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTP1P59025 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTP1P59025 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTP1P59025 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTP1P59025 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTP1P59025 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTP1P59025 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP1P59025 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP1P59025 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP1P59025 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP1P59025 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP1P59025 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP1P59025 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP1P59025 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP1P59025 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP1P59025 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP1P59025 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP1P59025 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP1P59025 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP1P59025 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP1P59025 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP1P59025 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP1P59025 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP1P59025 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP1P59025 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP1P59025 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP1P59025 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP1P59025 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP1P59025 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP1P59025 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP1P59025 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP1P59025 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP1P59025 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP1P59025 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP1P59025 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP1P59025 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP1P59025 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP1P59025 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP1P59025 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP1P59025 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP1P59025 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP1P59025 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP1P59025 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP1P59025 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP1P59025 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP1P59025 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP1P59025 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP1P59025 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP1P59025 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP1P59025 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP1P59025 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP1P59025 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP1P59025 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP1P59025 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP1P59025 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP1P59025 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP1P59025 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP1P59025 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP1P59025 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP1P59025 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP1P59025 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP1P59025 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP1P59025 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP1P59025 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP1P59025 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP1P59025 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP1P59025 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP1P59025 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP1P59025 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP1P59025 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP1P59025 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP1P59025 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP1P59025 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP1P59025 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP1P59025 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP1P59025 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP1P59025 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP1P59025 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms