Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl9P51670 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms