Protein–RNA interactions for Protein: P48757

Gast, Gastrin, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GastP48757 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GastP48757 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GastP48757 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GastP48757 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GastP48757 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GastP48757 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GastP48757 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GastP48757 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GastP48757 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GastP48757 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GastP48757 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GastP48757 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GastP48757 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GastP48757 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GastP48757 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GastP48757 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GastP48757 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GastP48757 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GastP48757 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GastP48757 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GastP48757 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GastP48757 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GastP48757 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GastP48757 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GastP48757 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GastP48757 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GastP48757 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GastP48757 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GastP48757 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GastP48757 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GastP48757 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GastP48757 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GastP48757 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GastP48757 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GastP48757 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GastP48757 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GastP48757 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GastP48757 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GastP48757 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GastP48757 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GastP48757 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GastP48757 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GastP48757 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GastP48757 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GastP48757 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GastP48757 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GastP48757 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GastP48757 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GastP48757 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GastP48757 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GastP48757 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GastP48757 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GastP48757 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GastP48757 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GastP48757 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GastP48757 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GastP48757 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GastP48757 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GastP48757 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GastP48757 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GastP48757 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GastP48757 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GastP48757 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GastP48757 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GastP48757 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GastP48757 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GastP48757 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GastP48757 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GastP48757 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GastP48757 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GastP48757 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GastP48757 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GastP48757 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GastP48757 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GastP48757 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GastP48757 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GastP48757 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GastP48757 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GastP48757 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GastP48757 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GastP48757 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GastP48757 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GastP48757 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GastP48757 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GastP48757 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GastP48757 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GastP48757 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GastP48757 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GastP48757 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GastP48757 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GastP48757 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GastP48757 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GastP48757 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GastP48757 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GastP48757 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GastP48757 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GastP48757 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GastP48757 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GastP48757 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GastP48757 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms