Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CratP47934 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CratP47934 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CratP47934 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CratP47934 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CratP47934 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CratP47934 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CratP47934 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CratP47934 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CratP47934 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CratP47934 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CratP47934 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CratP47934 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CratP47934 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CratP47934 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CratP47934 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CratP47934 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CratP47934 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CratP47934 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CratP47934 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CratP47934 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CratP47934 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CratP47934 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CratP47934 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CratP47934 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CratP47934 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CratP47934 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CratP47934 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CratP47934 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CratP47934 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CratP47934 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CratP47934 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CratP47934 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CratP47934 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CratP47934 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CratP47934 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CratP47934 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CratP47934 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CratP47934 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CratP47934 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CratP47934 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CratP47934 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CratP47934 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CratP47934 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CratP47934 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CratP47934 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CratP47934 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CratP47934 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CratP47934 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CratP47934 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CratP47934 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CratP47934 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CratP47934 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CratP47934 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CratP47934 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CratP47934 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CratP47934 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CratP47934 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CratP47934 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CratP47934 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CratP47934 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CratP47934 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CratP47934 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CratP47934 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CratP47934 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CratP47934 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CratP47934 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CratP47934 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CratP47934 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CratP47934 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CratP47934 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CratP47934 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CratP47934 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CratP47934 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CratP47934 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CratP47934 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CratP47934 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CratP47934 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CratP47934 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CratP47934 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CratP47934 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CratP47934 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CratP47934 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CratP47934 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CratP47934 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CratP47934 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CratP47934 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CratP47934 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CratP47934 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CratP47934 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CratP47934 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CratP47934 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CratP47934 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CratP47934 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CratP47934 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CratP47934 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CratP47934 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CratP47934 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CratP47934 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CratP47934 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms