Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5cP41230 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms