Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa10P31310 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa10P31310 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa10P31310 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa10P31310 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa10P31310 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa10P31310 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa10P31310 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa10P31310 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa10P31310 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa10P31310 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa10P31310 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa10P31310 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa10P31310 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa10P31310 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa10P31310 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa10P31310 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa10P31310 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa10P31310 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa10P31310 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa10P31310 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa10P31310 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa10P31310 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa10P31310 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa10P31310 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa10P31310 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa10P31310 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms