Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casp1P29452 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp1P29452 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Casp1P29452 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casp1P29452 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casp1P29452 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casp1P29452 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms