Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms