Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spi1P17433 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spi1P17433 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spi1P17433 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spi1P17433 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spi1P17433 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spi1P17433 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spi1P17433 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spi1P17433 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms