Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NclP09405 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NclP09405 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NclP09405 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NclP09405 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NclP09405 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NclP09405 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NclP09405 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NclP09405 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NclP09405 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NclP09405 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NclP09405 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NclP09405 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NclP09405 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NclP09405 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NclP09405 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NclP09405 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NclP09405 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NclP09405 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NclP09405 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NclP09405 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NclP09405 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NclP09405 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NclP09405 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NclP09405 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NclP09405 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NclP09405 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NclP09405 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NclP09405 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NclP09405 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NclP09405 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NclP09405 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NclP09405 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NclP09405 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NclP09405 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NclP09405 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NclP09405 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NclP09405 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NclP09405 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NclP09405 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NclP09405 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NclP09405 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NclP09405 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NclP09405 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NclP09405 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NclP09405 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NclP09405 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NclP09405 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NclP09405 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NclP09405 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NclP09405 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NclP09405 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NclP09405 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NclP09405 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NclP09405 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NclP09405 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NclP09405 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NclP09405 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NclP09405 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NclP09405 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NclP09405 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NclP09405 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NclP09405 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NclP09405 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NclP09405 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NclP09405 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NclP09405 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NclP09405 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NclP09405 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NclP09405 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NclP09405 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NclP09405 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NclP09405 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NclP09405 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NclP09405 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NclP09405 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NclP09405 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NclP09405 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NclP09405 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NclP09405 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NclP09405 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NclP09405 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NclP09405 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NclP09405 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NclP09405 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NclP09405 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NclP09405 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NclP09405 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NclP09405 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NclP09405 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NclP09405 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NclP09405 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NclP09405 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NclP09405 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NclP09405 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NclP09405 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NclP09405 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NclP09405 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NclP09405 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NclP09405 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms