Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01725 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01725 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01725 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01725 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01725 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01725 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01725 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01725 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01725 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01725 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01725 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01725 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01725 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01725 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01725 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01725 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01725 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01725 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01725 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01725 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01725 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01725 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01725 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01725 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01725 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01725 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01725 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01725 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01725 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01725 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01725 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01725 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01725 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01725 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01725 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01725 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01725 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01725 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01725 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01725 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01725 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01725 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01725 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01725 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01725 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01725 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01725 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01725 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01725 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01725 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01725 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01725 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01725 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01725 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01725 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01725 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01725 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01725 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01725 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01725 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01725 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01725 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01725 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01725 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01725 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01725 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01725 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01725 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01725 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01725 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01725 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01725 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01725 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01725 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01725 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01725 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01725 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01725 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01725 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01725 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01725 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01725 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01725 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01725 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01725 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01725 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01725 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01725 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01725 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01725 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01725 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01725 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01725 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01725 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01725 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01725 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01725 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01725 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01725 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms