Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx8O88983 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx8O88983 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx8O88983 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx8O88983 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx8O88983 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx8O88983 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx8O88983 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx8O88983 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx8O88983 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx8O88983 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx8O88983 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx8O88983 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx8O88983 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Stx8O88983 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx8O88983 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx8O88983 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
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