Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dll3O88516 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dll3O88516 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dll3O88516 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dll3O88516 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dll3O88516 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dll3O88516 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dll3O88516 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dll3O88516 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dll3O88516 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dll3O88516 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dll3O88516 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dll3O88516 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dll3O88516 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms