Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms