Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms