Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.048e-8■■■■■ 28.4
DKC1O60832 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.067e-28■■■■■ 28.3
DKC1O60832 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.97e-28■■■■■ 28.3
DKC1O60832 TBX2-AS1-204ENST00000591313 640 ntTSL 220.78■□□□□ 0.927e-28■■■■■ 28.3
DKC1O60832 TBX2-AS1-205ENST00000592009 330 ntTSL 318.49■□□□□ 0.557e-28■■■■■ 28.3
DKC1O60832 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 28.3
DKC1O60832 INPP5D-204ENST00000445964 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 28.3
DKC1O60832 INPP5D-202ENST00000415617 3628 ntTSL 512.16□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 28.3
DKC1O60832 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.67e-28■■■■■ 28.3
DKC1O60832 RPL32P3-207ENST00000514355 2816 ntTSL 214.79□□□□□ -0.044e-10■■■■■ 28.2
DKC1O60832 RPL32P3-206ENST00000510078 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.694e-10■■■■■ 28.2
DKC1O60832 RPL32P3-208ENST00000515866 702 ntTSL 310.13□□□□□ -0.794e-10■■■■■ 28.2
DKC1O60832 RPL32P3-202ENST00000499631 593 ntTSL 49.1□□□□□ -0.954e-10■■■■■ 28.2
DKC1O60832 TNS1-210ENST00000446903 2464 ntTSL 1 (best)15.07■□□□□ 03e-7■■■■■ 28.2
DKC1O60832 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.655e-8■■■■■ 28.2
DKC1O60832 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.085e-8■■■■■ 28.2
DKC1O60832 KDSR-211ENST00000591902 1011 ntTSL 213.71□□□□□ -0.215e-8■■■■■ 28.2
DKC1O60832 KDSR-205ENST00000586791 3384 ntTSL 29.87□□□□□ -0.835e-8■■■■■ 28.2
DKC1O60832 KDSR-209ENST00000589592 688 ntTSL 34.29□□□□□ -1.725e-8■■■■■ 28.2
DKC1O60832 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.228e-7■■■■■ 28.2
DKC1O60832 PVT1-201ENST00000504719 754 ntTSL 228.43■■■□□ 2.148e-7■■■■■ 28.2
DKC1O60832 PVT1-215ENST00000522963 568 ntTSL 413.31□□□□□ -0.288e-7■■■■■ 28.2
DKC1O60832 PVT1-216ENST00000523068 844 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.458e-7■■■■■ 28.2
DKC1O60832 PVT1-207ENST00000518528 624 ntTSL 39.96□□□□□ -0.828e-7■■■■■ 28.2
DKC1O60832 PVT1-205ENST00000517790 599 ntTSL 25.78□□□□□ -1.488e-7■■■■■ 28.2
DKC1O60832 ARHGAP32-204ENST00000525234 719 ntTSL 334.77■■■■□ 3.163e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.722e-27■■■■■ 27.9
DKC1O60832 MARK4-209ENST00000592762 683 ntTSL 527.83■■■□□ 2.052e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 LRRC8D-205ENST00000525774 588 ntTSL 427.05■■□□□ 1.925e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 CALCOCO2-209ENST00000507076 767 ntTSL 325.71■■□□□ 1.713e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.692e-27■■■■■ 27.9
DKC1O60832 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.633e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.613e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.523e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 MACF1-211ENST00000467673 792 ntTSL 324.12■■□□□ 1.453e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.433e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 IMPA2-210ENST00000590107 1616 ntTSL 523.73■■□□□ 1.393e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 RERE-210ENST00000468247 414 ntTSL 223.45■■□□□ 1.343e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.332e-27■■■■■ 27.9
DKC1O60832 TBC1D22A-204ENST00000394449 2048 ntTSL 523.11■■□□□ 1.293e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 IMPA2-202ENST00000383376 1575 ntTSL 1 (best)22.97■■□□□ 1.273e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 C11orf24-207ENST00000532534 687 ntTSL 322.86■■□□□ 1.255e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 IMPA2-205ENST00000588752 651 ntTSL 322.78■■□□□ 1.243e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.23e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SPATS2L-221ENST00000459656 1901 ntTSL 1 (best)22.47■■□□□ 1.192e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 IMPA2-211ENST00000590138 895 ntTSL 522.34■■□□□ 1.173e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 MARK4-208ENST00000592207 789 ntTSL 322.31■■□□□ 1.162e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.123e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.113e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SPATS2L-225ENST00000471533 329 ntTSL 321.92■■□□□ 1.12e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.093e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.083e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 CLASRP-215ENST00000592056 582 ntTSL 221.67■■□□□ 1.063e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.062e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 DCAF6-206ENST00000455334 796 ntTSL 521.54■■□□□ 1.042e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 MARK4-205ENST00000588621 2024 ntTSL 221.48■■□□□ 1.032e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.46■■□□□ 1.033e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SPATS2L-216ENST00000444012 605 ntTSL 421.13■□□□□ 0.972e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.933e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 DCAF6-205ENST00000450548 724 ntTSL 320.6■□□□□ 0.892e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.843e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SPATS2L-211ENST00000423749 771 ntTSL 520.28■□□□□ 0.842e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SPATS2L-212ENST00000428692 541 ntTSL 420.22■□□□□ 0.832e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SPATS2L-220ENST00000457757 835 ntTSL 520.22■□□□□ 0.832e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 PXN-203ENST00000323871 5457 ntTSL 220.2■□□□□ 0.823e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.813e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 PXN-214ENST00000547983 1004 ntTSL 520.05■□□□□ 0.83e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.83e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.793e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.783e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 PXN-212ENST00000547746 579 ntTSL 419.9■□□□□ 0.783e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 IMPA2-204ENST00000588167 885 ntTSL 219.83■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.762e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.753e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.743e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SMG6-214ENST00000573827 601 ntTSL 319.5■□□□□ 0.713e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.713e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.683e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.663e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 C11orf24-204ENST00000529590 610 ntTSL 319.04■□□□□ 0.645e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.633e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 MACF1-227ENST00000524432 4338 ntTSL 518.99■□□□□ 0.633e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.613e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.613e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.533e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 C11orf24-203ENST00000529339 603 ntTSL 218.3■□□□□ 0.525e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 PIP5K1C-204ENST00000587482 1311 ntTSL 518.23■□□□□ 0.513e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.52e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 PXN-205ENST00000440827 516 ntTSL 418.04■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 DCAF6-208ENST00000470721 2803 ntTSL 217.96■□□□□ 0.472e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.412e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.45e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.342e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SMG6-220ENST00000576218 902 ntTSL 317.15■□□□□ 0.343e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 CLASRP-202ENST00000391952 2213 ntTSL 1 (best)17.01■□□□□ 0.313e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.273e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 C11orf24-208ENST00000532969 485 ntTSL 216.56■□□□□ 0.245e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.243e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 27.9
Retrieved 100 of 8,567 protein–RNA pairs in 145.4 ms