Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna3O08545 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna3O08545 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna3O08545 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna3O08545 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna3O08545 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna3O08545 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Efna3O08545 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Efna3O08545 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efna3O08545 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efna3O08545 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efna3O08545 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efna3O08545 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.9 ms