Protein–RNA interactions for Protein: O00409

FOXN3, Forkhead box protein N3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3O00409 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXN3O00409 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXN3O00409 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXN3O00409 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXN3O00409 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXN3O00409 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXN3O00409 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXN3O00409 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXN3O00409 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms