Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rhox13F6YCR7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhox13F6YCR7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms