Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Trappc8E9PWG2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trappc8E9PWG2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms