Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms