Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh13Q9WTR5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh13Q9WTR5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh13Q9WTR5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh13Q9WTR5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh13Q9WTR5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh13Q9WTR5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh13Q9WTR5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh13Q9WTR5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh13Q9WTR5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh13Q9WTR5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh13Q9WTR5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh13Q9WTR5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh13Q9WTR5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh13Q9WTR5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh13Q9WTR5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh13Q9WTR5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh13Q9WTR5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh13Q9WTR5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh13Q9WTR5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh13Q9WTR5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh13Q9WTR5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh13Q9WTR5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh13Q9WTR5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh13Q9WTR5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.9 ms