Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY0

PRND, Prion-like protein doppel, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNDQ9UKY0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRNDQ9UKY0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRNDQ9UKY0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRNDQ9UKY0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRNDQ9UKY0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRNDQ9UKY0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms