Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SCN11AQ9UI33 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms