Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms