Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CtsfQ9R013 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms