Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms