Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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Bco1Q9JJS6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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Bco1Q9JJS6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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Bco1Q9JJS6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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