Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GORASP1Q9BQQ3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms