Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rnf17Q99MV7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms