Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlgn1Q99K10 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlgn1Q99K10 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms