Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms