Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI5

SLC44A1, Choline transporter-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A1Q8WWI5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC44A1Q8WWI5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC44A1Q8WWI5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC44A1Q8WWI5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC44A1Q8WWI5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC44A1Q8WWI5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC44A1Q8WWI5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC44A1Q8WWI5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC44A1Q8WWI5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC44A1Q8WWI5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC44A1Q8WWI5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC44A1Q8WWI5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC44A1Q8WWI5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC44A1Q8WWI5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC44A1Q8WWI5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms