Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms