Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Z0

Rtn4rl2, Reticulon-4 receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rl2Q7M6Z0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4rl2Q7M6Z0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms