Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxd1Q61345 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxd1Q61345 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxd1Q61345 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxd1Q61345 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Foxd1Q61345 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Foxd1Q61345 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Foxd1Q61345 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxd1Q61345 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxd1Q61345 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxd1Q61345 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxd1Q61345 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxd1Q61345 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxd1Q61345 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxd1Q61345 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxd1Q61345 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxd1Q61345 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxd1Q61345 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxd1Q61345 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxd1Q61345 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxd1Q61345 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxd1Q61345 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxd1Q61345 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxd1Q61345 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxd1Q61345 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxd1Q61345 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxd1Q61345 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxd1Q61345 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxd1Q61345 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxd1Q61345 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxd1Q61345 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxd1Q61345 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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